但是，近年乙肝分子生物学研究发现，大部分单纯HBsAg阳性者体内乙肝病毒已被清除，仅血中还有乙肝表面抗原。因此，肝表面抗原携带者并不等于乙肝病毒携带者，更不等于现症乙肝病人，乙肝表面抗原阳性也并不完全代表有传染性。　 　

　 　为什么乙肝表面抗原携带者体内又没有乙肝病毒呢？这是因为乙肝病毒被消除后，乙肝病毒的部分基因整合到了肝细胞的基因内，构成"合资企业"，HBsAg作为"合资企业"的一种产品持续出现在血液中。因为整合的病毒基因常是缺损的，往往只能复制出HBsAg、很少或者不产生HBeAg等，所以，除了HBsAg以外，查不出其他的乙肝病毒标志物。近年，科研人员将指导乙肝表面抗原合成的乙肝病毒核酸片段插入到酵母或其他细胞的核酸中，使这些细胞产生乙肝表面抗原，制造乙肝基因工程疫苗。而这些能产生乙肝表面抗原的细胞都不含乙肝病毒。台湾科研人员发现，单纯HBsAg阳性者仅7.4%血中又检出乙肝病毒。有人检查25名单纯HBsAg阳性母亲的新生儿，仅21%被传染乙肝，而HBsAg也阳性的47名双阳母亲（一般双阳母亲体内都带有乙肝病毒），其新生儿96%被传染乙肝。这些调查结果都表明，绝大多数单纯HBsAg阳性者，体内并无乙肝病毒，也不传染他人。

　　单纯HBsAg阳性者，大多预后良好。有人追踪观察92例乙肝表面抗原携带者，10年后无一人发生与肝炎有关的死亡或肝细胞癌。单纯乙肝表面抗原携带者可照常工作和学习，也不需要特别的抗病毒药物治疗，但应定期上医院做乙肝"两对半"及肝功能检查。

　　研究者认为，单纯HBsAg阳性者虽不等于乙肝病毒携带者，但体内携带乙肝病毒的可能性仍然存在，故仍应注意传染，更不能献血。