与成人一样，儿童的急性感染过程也不尽相同。在婴儿，尽管有暴发性乙型肝炎的个案报道，绝大多数是无症状的。在推行普遍的疫苗接种之后，台湾婴幼儿暴发性乙型肝炎的病死率从1975～1984年的5.36/100000下降到1985～1998年的1.71/100000。

　　婴幼儿感染HBV后可患Gianotti－Crosti综合征，其特征为面部、四肢和躯干以丘疹为主的皮炎。这可能是该年龄组感染HBV相关的唯一临床表现，当然此综合征也可能与其它病毒感染有关。稍大儿童急性感染后可出现轻微的全身症状或严重的肝炎。人体感染HBV后发展成为慢性感染的比例与感染时的年龄相关：婴儿期感染90%以上会发展成为慢性感染，而成人只有5%，儿童介于两者之间。

　　大多数HBV慢性感染的儿童可以正常生长发育，除非发生肝硬化或肝细胞癌，儿童慢性感染的症状并不明显。有时会有肝外疾病，比如膜增生性肾小球肾炎。